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單細(xì)胞分離和mRNA標(biāo)記流程

更新時間:2025-04-15      點擊次數(shù):456
單細(xì)胞表達(dá)分析系統(tǒng)更有效的測序可以更低的成本實現(xiàn)更高的通量:由于與高通量實驗方法相關(guān)的測序成本,單細(xì)胞實驗往往非常昂貴。BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng)設(shè)計有多個功能,可以更有效地利用測序來降低實驗成本。
靶向測定-由于檢測靈敏度的提高,特定的基因組合方法可使用少量的時間和成本,幫助產(chǎn)生類似于全轉(zhuǎn)錄組分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)測定的結(jié)果。這種方法還提高了UMI計數(shù)效率,從而極大程度的節(jié)省了實驗時間和成本。
儲存-從樣本中得到的完整cDNA可在磁珠上穩(wěn)定存儲,允許將珍貴樣本保存長達(dá)16周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進(jìn)行測序,并通過對儲存的磁珠池進(jìn)行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。
分樣-在磁珠上儲存的cDNA可以分成一個或多個等分試樣,并使用定制或預(yù)先設(shè)計的組合(panel)進(jìn)行擴增。通過提供對部分樣本進(jìn)行測序的選項和對樣本不同組合(panel)進(jìn)行測試的靈活性,分樣可降低成本。
單細(xì)胞分離和mRNA標(biāo)記流程:
1.在微孔中,一個細(xì)胞與一個條碼標(biāo)記磁珠匹配
2.裂解細(xì)胞將mRNA與磁珠上條碼標(biāo)記的捕獲寡核苷酸雜交
3.磁珠回收
4.cDNA合成
5.測序和構(gòu)建單細(xì)胞基因表達(dá)譜
 
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